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大数据在基因检测行业作用重要吗?基因检测的哪个环节需要大数据的数据库??


大数据在基因检测行业作用重要吗?基因优艾设计网_PS论坛检测的哪个环节需要大数据的数据库?
卖扫描仪的人 优艾设计网_在线设计 2021-10-28 04:35


未病基因检测(疾病风险评估):尚属非常初期阶段,需要未来研究支持及大数据支撑。未病基因检测是指通过对人体进行基因测序,结合一些已知的疾病和基因之间的关联数据,“推测”出该个体患某种疾病的概率。基于与基因检测靶向药物相同的原因,以及我们所知的疾病是外界环境和内在基因共同作用的结果,未病基因检测(疾病风险评估)尚属非常初期阶段。


ty_123411537 2021-10-28 05:00


目前基因检测手段很成熟,很多实验室都能实现,然而检测结果的解读却非常困难,因为这依赖于基于大数据上的数据库。
比如,Myriad最值得骄傲的就是拥有专有数据库,它用来解释不确定的遗传检测结果。如果其他公司不被允许在BRCA基因测试中使用Myriad的私有数据库,这道屏障和战略优势将非常显着。当然,随着时间的推移这种优势会慢慢减弱,但是无论如何,这从侧面说明了数据库在基因检测中的核心作用。
一些主做基因检测试剂盒的跨国公司的转型的事实非常有说优艾设计网_电脑技术服力,据悉它们已经开始把未来的业务重点放在了基因信息学之上,虽然短时期内还未能带来任何利润,但已经成为“行业进化”中的必须环节。临床验证是在需要大量的时间和金钱花费,而更广泛的验证才能构建真正的数据库,因为这些新设备和新技术变得更便宜和可用。但如何将转化为生物或临床结果还是很难。而且,很多国家的医院医生并没有更多的遗传性和信息学知识,对遗传密码更是一无所知。


李国库 优艾设计网_PS论坛 2021-10-28 05:01


说一说基因测序里的大数据分析吧。

目前的主流测序方法是二代测序。而二代测序方式会产生大量的数据(测一段DNA会产生几十几百G的数据吧),而由于测出来的数据是基因片段数据,还需要用算法进行数据拼接等工作。所以需要的计算量还是挺大的。而且现在测序仪器越来越好,产生的数据量越来越多,所以需要计算的东西就更多了。

因此,现在测序领域的算法设计是很重要的。设计一个高效的算法,可以把计算时间大大减少。

至于大数据的数据库(例如Hadoop、Hbase之类的工具),跟所谓的基因数据库并不是同一个层面的东西。大数据的数据库是为了存放和处理大量数据的软件,而基因数据库,例如NCBI,则是一个应用,直接负责收集和提供数据了。


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