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"Blue"这款DNA序列误差校正工具怎么样??

137****3815 优艾设计网_在线设计 2021-09-24 10:03


目前呢,研究人员,将最好的误差校正工具与标准的生物信息学分析流程相结合,可以产生更高质量的基因组数据和更准确预估的基因变异。
然而,"Blue"这款DNA序列误差校正工具也不能完全准确得校正。
因为准确地校正误差本身就是一个难题,主要是因为基因组的重复性和模糊性。不过,校正简单的碱基置换(substitution)误差是很容易的


淡淡芬芳 优艾设计网_PS问答 2021-09-24 10:07


“Blue”这款DNA序列校正工具是由澳大利亚悉尼大学的研究人员与英联邦科学与工业研究组织(CSIRO)的同事最近发布的。Blue是一种高性能的C#应用程序,可在Windows系统、Mono on Linux和OS X运行。
Blue的特点有:
1、明显快于其他可用的工具,特别在Windows系统中,更加准确。

2、它能纠正所有三种类型的可能误差(substitutions、deletions和insertions),使其适合用于Roche 454和Life Technologies Ion Torrent系统所产生的测序数据。

3、可校正与另一组读长具有一致序列的一组读长,即“交叉校正cross-correction”方法。


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