基于千种植物转录组数据集的在线Blast比对平台好不好用？？

在线Blast比对平台是基于千种植物转录组项目（OneKP Project）的数据集而建立的。其中，OneKP项目是由加拿大科学家在2008年11月发起，由深圳华大基因研究院负责对1000多种植物包括藻类、陆地及水生植物的转录组进行测序，在进化分析及植物功能注释分析上已取得大量成果。该平台收录了该项目的所有测序数据，并依托深圳华大基因研究院强大的计算资源，提供在线Blast分析服务。截止至2014年9月22日，已有注册用户631人，已完优艾设计网_Photoshop百科成任务量48456个。目前，OneKP项目的数据将通过该平台逐步公开。
该平台包括5个blast工具，即blastn、tblastn、tblastx、blastp、blastx，可针对性的选择参考物种数据集，使得数据分析的针对性更高，这是植物研究者们的一大福音。
平台网址：http://www.bioinfodata.org/app/Blast4OneKP/

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昨日重现uu 2021-09-05 20:34

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好用

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北北大北妞 优艾设计网_设计模板 2021-09-05 20:48

很大一部分人在使用。在线Blast比对平台是基于千种植物转录组项目的数据集而建立的。该平台收录了该项目的所有测序数据，并依托深圳华大基因研究院强大的计算资源，提供在线Blast分析服务。目前，OneKP项目的数据将通过该平台逐步公开。

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龚静静 2021-09-05 20:59

这批数据很好，规范程度较高，可用性强。

这种服务方式用户很熟悉，用了十几年了，可以考虑更新一下。比如送到AWS上去，也可以开放接口，支持大规模的比对，适当收点费也O优艾设计网_在线设计K。同时Blast未免单调，加一点其他的工具和数据库做点联合分析就更赞了。技术资源充足的话可以考虑鼓励用户接入自己的工具，共享比对和分析结果，再整两个人将新的用户数据合并入库，那就牛掰了。扯远了，这要是都实现了，就秒了DNANEXUS

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