PacBio RS有哪些应用呢??
今年4月,美国Pacific Biosciences 公司正式发售第三代测序系统—PacBio RS。这是一台革优艾设计网_设计圈命性的DNA测序系统,它融合了新颖的单分子测序技术和高级的分析技术,在测序历史上首次实现了人类观测单个DNA聚合酶合成过程的梦想。
鸡鸡哥 2021-08-17 02:32
PacBio RS有以下四点应用:
1.甲基化分析
美国芝加哥大学利用第三代单分子SMRT测序技术和5-hmC的选择性化学标记方法来高通量检测5-hmC。通过聚合酶动力学带来的宝贵信息,研究人员可直接检测DNA甲基化,包括N6-甲基腺嘌呤、5-mC和5-hmC。
2.病原微生物鉴定
由于PacBio从样本制备到获得序列信息所需时间非常短(<1天),在具有时效性的病原微生物鉴定中(例如生物反恐、流行病爆发监控等)也非常有优势。一个国际小组利用Pacific Biosciences的单分子测序技术,深入研究了欧洲大肠杆菌菌株的致病性和进化起源,该研究成果发表在《新英格兰医学杂志》上。
3.高GC含量区域测序
美国加州大学戴维斯分校医学院利用单分子实时测序技术,对脆性X染色体综合征的关键基因FMR1中的CGG三核苷酸重复区域进行了测序。
4.稀有突变检测
PacBio无需扩增、对每一个单分子模板都进行评估,对于混合群体中低至 1/100的稀有突优艾设计网_设计圈变都可以检出。
http://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htm
http://www.ebiotrade.com/newsf ... 3.htm
http://www.ebiotrade.com/newsf ... 1.htm
http://www.ebiotrade.com/emgzf ... 5.pdf
ty_127385356 2021-08-17 02:44 优艾设计网_设计
PacBio的读长可以达到10kb以上,因此对于较小的微生物基因组,可以直接测通了,都不用拼接;
另外如果测转录组的话,可以获得全长转录本测序,拼接上肯定要比二代测序更准确和方便。
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