基于候选区域的关联分析有什么意义？？
薛子路
2021-08-11 01:22
从关联分析的规模来说，一般有基于候选基因的关联分析方法和全基因组的关联分析方法。候选的关联分析方法可以从已知基因的功能出发，在群体中扩增分析这样特定基因，也可以从QTL mapping的结果出优艾设计网_设计LOGO发，对某一区段的所有基因进行关联分析。最经典的例子就是玉米维生素代谢途径的候选基因关联分析法，利用这个方法找到了几个基因的几个位点，对群体中维生素含量的变异贡献率达到58%以上，把这些位点转化成标记，成功的利用到玉米的育种之中，有希望育成“golden maize”，与“dolden rice”相对应。
360U2579147582 优艾设计网_Photoshop百科 2021-08-11 01:34
当用STR作连锁分析或细胞遗传学方法发现某一区域或染色体上的条带与疾病表型相连锁,研究者可在该区域以每10kb中选1个SNP的密度研究与疾病表型相关的位点,由于候选区域大小一般在5-30cM之间,所以一个项目研究一般要选用500-3000个SNPs作遗传标志。所需的病例样本数同上,当然是越多越好,最好1000例以上。基于候选区域的关联分析的最大优点是提供了发现新的疾病易感基因的可能。
从关联分析的规模来说，一般有基于候选基因的关联分析方法和全基因组的关联分析方法。候选的关联分析方法可以从已知基因的功能出发，在群体中扩增分析这样特定基因，也可以从QTL mapping的结果出优艾设计网_设计LOGO发，对某一区段的所有基因进行关联分析。最经典的例子就是玉米维生素代谢途径的候选基因关联分析法，利用这个方法找到了几个基因的几个位点，对群体中维生素含量的变异贡献率达到58%以上，把这些位点转化成标记，成功的利用到玉米的育种之中，有希望育成“golden maize”，与“dolden rice”相对应。
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