HiTS-FLIP技术是怎样的？？
andeqiu
2021-08-08 01:34
2011年,麻省理工学院的Nutiu等研究人员利用新一代测序仪定量测定DNA-蛋白质结合亲和力,提出了研究转录因子DNA结合谱的新技术——HiTS-FLIP。该技术的主要原理及实验流程见图8所示。在该研究中,用HiTS-FLIP技术研究了酵母转录激活因子Gcn4与DNA的结合,该蛋白是酵母氨基酸饥饿应答的主要调控者。首先,制备了一个随机25聚体的DNA文库,将其放入Illumina Solexa测序仪中,完成测序。之后变性,剥离测序延伸链,利用新的引物和Klenow酶合成新链。再加入与单体(m)OrBurge结合的GCN优艾设计网_设计圈4蛋白,并对蛋白结合进行荧光成像。最后,在测序图像上叠加蛋白结合图像,判定蛋白对各种序列的结合亲和性。
2011年,麻省理工学院的Nutiu等研究人员利用新一代测序仪定量测定DNA-蛋白质结合亲和力,提出了研究转录因子DNA结合谱的新技术——HiTS-FLIP。该技术的主要原理及实验流程见图8所示。在该研究中,用HiTS-FLIP技术研究了酵母转录激活因子Gcn4与DNA的结合,该蛋白是酵母氨基酸饥饿应答的主要调控者。首先,制备了一个随机25聚体的DNA文库,将其放入Illumina Solexa测序仪中,完成测序。之后变性,剥离测序延伸链,利用新的引物和Klenow酶合成新链。再加入与单体(m)OrBurge结合的GCN优艾设计网_设计圈4蛋白,并对蛋白结合进行荧光成像。最后,在测序图像上叠加蛋白结合图像,判定蛋白对各种序列的结合亲和性。
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