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唾液取样能够上NGS么,样品量够不够??


现在做基因检测用唾液和口腔拭子,但是N优艾设计网_PS问答GS测序对样本的要求比较高,唾液能达到么?NGS做重测序需要多少量?
吴擒虎 2021-07-03 04:21


DNA G优艾设计网_设计百科enotek的那个Og-500就是为全基因组设计的吧


189****7666 优艾设计网_设计百科 2021-07-03 04:38


曾有实验显示是搜集700ul唾液能够提取获得约18ug gDNA,这一个方面可能是唾液中gDNA含量不等等原因有关,就算我们按照1ml 唾液大约最多能够提取获得~200ng gDNA来计算:

NGS平台,如果是最常用的HiSeq 2000,需要1.2ug最低起始量来构建常规shotgun文库;若构建designated insert size shotgun library则最低起始量需要3.0ug。HiSeq X Ten测序平台文库构建起始量也需要2-3.0ug。

可见一次搜集提取量是不太够的,可以通过多次采集唾液来进行搜集,不过建议直接采集外周血更为方便,希望对您问题的解决有帮助。


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