关于NGS三大类型错误的几个问题?
Nature综述:NGS实验中的错误来自哪里?如何减少?
近期读了一篇 Nature综述:NGS实验中的错误来自哪里?如何减少? 的文章,里面有几个点不是很了解,请高手指点一下.
1.DNA起始量低。早在2005年人们就发现,在PCR过程中,DNA起始量低的模板会以序列依赖的方式产生虚假的突变,主要是从G转变为A。
这里说的"DNA起始量优艾设计网_设计低的模板会以序列依赖的方式产生虚假的突变",不是很能理解,能否解析一下这个PCR过程量低为什么引起突变?序列依赖又是什么.
M29****6316 2021-06-23 20:46 优艾设计网_电脑技术
来源于文库制备的测序错误
1. 用户错误;例如,一个样品的DNA残留到下一个,之前反应的污染。
2. PCR扩增错误。这个同上面第4点。生物通 www.ebiotrade.com
3. 引物偏向;例如,结合偏向,甲基化偏向,错配导致的偏向,非特异性结合和引物二聚体的形成,发夹结构和干扰环,熔解温度太高或太低引入的偏向。
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