现在基因测序的瓶颈主要在哪里？？

现在基因测序的瓶颈主要在优艾设计网_设计哪里？精度？速度？

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u优艾设计网_设计LOGO_108wuai819 2021-06-16 15:16

其实这个问题，我想简单的说一下：
一代测序，也就是sanger测序，是最普通的测序的方法，这个方法的原理很简单，最基本的应用就是获取一段基因的序列信息，其实题主说的测序应用很少应该不包括这个方法，至少在我们实验，这个方法还是得到了很大的应用的；
二代测序，Next-generation Sequencing，又被成为高通量测序，现在主要针对二代测序的平台主要是illumina测序平台，lifetech（现在被thermo收购了）的ion torrent平台，还有之前的Roche 454平台，这些平台都各有各的优势，454的读长长，illumina通量高，时间快，ion torrent成本较低，但是这三个平台都没有客服二代测序最深刻的短板——测序成本相当之高。这里说的成本高不只是花钱花的多，而且后期的测序数据出来个10个G都是少的，处理这些数据需要极强的生物信息学的背景，这方面的人才的成本真心的高；另外我见过几个实验室买过二代测序仪，主要就是Hiseq和ion torrent，但是真正用起来的实验室真心的少，大部分还是在那贡着吧！！所以说题主说的精度和速度只是其中的一个原因（这两个就先不吐槽了），想做二代测序，你先成就一个生物信息学的博士再说吧，否则免谈。。。要不就乖乖的送公司做——成本在10-20W之间！！
第三代的测序仪，即所谓的单分子测序，可以测的长度很高，但是会引入第二代测序很少出现的indel（插入，缺失）的情况。

从数据分析上看，高通量，大数据的分析，在计算机的存储和计算资源的消耗上都是很高的。
从实验室提取DNA，但最后得到分析结果，中间需要经历 建库-测序-比对/组装-变异检测-注释等 一系列实验和数据分析过程，第二代测序的方法动辄单个样本就上T的数据量都会使得分析过程耗时耗资源。

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