对于癌细胞进行单细胞测序的意义是什么??
对癌细胞优艾设计网_PS交流的测序可以理解,但是为什么要对癌细胞进行单细胞测序呢?
tracy0413 2021-05-26 09:04
这是因为在肿瘤组织中,癌细胞并不是均质的,癌细胞中的基因拷贝并不完全一致。以往的科学研究结果都认为癌症是细胞水平上的单个克隆疾病,也就是说下一代的肿瘤细胞从上一代的肿瘤细胞遗传模板完全复制而来。但是随着研究的深入,越来越多的证据说明肿瘤组织中的癌细胞克隆存在差异性,其中有些克隆是可以快速扩散的,分析这些单细胞的克隆就能了解癌细胞转移和复发的原因,以及它们抗药性的产生。
单细胞测序方法又称single cell sequencing(SNS),可以对一个单细胞核中基因拷贝数目进行准确定量。癌细胞的部分基因组往往会被删除,或者扩增,关键基因就会出现缺失,或者表达过量,正常细胞的生长被干扰,利用这种方法就可以分析基因拷贝数目,从而对癌症做出诊断。就是因为单细胞测序的优越性,所以近年来成为了癌症研究的热点之一。
比如,中国深圳华大基因研究院的研究人员对典型的JAK2阴性ET病人的90个单细胞进行了全外显子测序,测序结果鉴定了一些与ET的发生、发展相关的突变基因,并揭示了此ET在肿瘤发生中遵循单克隆演化模型。
也有科研人员对肾透明细胞癌进行了单细胞测序,发现试验者的肾癌并不是由常见的两个突变基因VHL和PBRM1导致,这说明癌症个性化治疗的重要性。测序结果发现此肾癌中没优艾设计网_设计模板有明显的克隆(细胞)亚群,并且发现了一些与此肾癌发生相关的重要功能基因。
159****7932 2021-05-26 09:08
肿瘤的单细胞测序,最主要的作用还是研究肿瘤发生、发展的机理,以及肿瘤细胞的特异性的治疗靶点。
单细胞全基因组测序技术是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是将分离的单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增,获得高覆盖率的完整的基因组之后通过外显子捕获进而高通量测序用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。
之前的测序优艾设计网_设计圈以及各种基因组计划,使用的测序材料无一例外都是数百万甚至更多细胞的混合DNA样本。这种方法能够得到全基因组序列信息,但是对其进行研究得到的结果只是一群细胞中信号的平均值,或者只代表其中占优势数量的细胞信息,单个细胞独有的特性被忽视。例如,科学家想找出哪种突变存在于哪种细胞中几乎是不可能的,只存在于少数细胞(如早期癌细胞)中的突变也基本上被掩藏。另一方面,有些样品稀少无法在实验室培养,样品量不足以进行全基因组分析,例如肿瘤循环细胞、组织微阵列、早期发育的胚胎细胞等。这些都是全基因组测序遇到的难题。作为“在单个细胞水平上对基因组进行测序”的单细胞测序技术能够解决上述难题。与传统的全基因组测序相比,单细胞测序不仅测量基因表达水平更加精确,而且还能检测到微量的基因表达子或罕见非编码RNA,其优势是全方位和多层次的。
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