核酸单位中mers, nt, bp有什么区别？

王逾涛 2021-04-21 02:46

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都是指一个碱基字符。
mers的概念经常用于序列组装上，是指把一条长的序列（DNA、RNA、reads或别的什么），逐碱基切割成短片段，这个短片段长度是多少就称为几mer。例如，对100bp的reads，按40mer（即40bp）逐碱基切割，一共可以得到100-40+1=51个40mer的片段。
我们知道，核苷酸由一个含氮碱基，一个五碳糖和一个磷酸基团组成；nt，即核苷酸（Nucleotide），是从核苷酸的角度描述核酸的一个单位长度；bp，即碱基对（base pair），是从含氮碱基的角度描述一个单位长度。

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